药店毛利率取决于经营内容，通常，药店的经营内容以药品、保健品、医疗器械、母婴用品为主，有些药店会涉及中医馆，康复保健以及电商平台等周边内容。

药品、保健品毛利率大约为35%～70%，当然，有类似于波立维、立普妥的药品几乎没有利润甚至负毛，具备区域优势的连锁药店因为集中采购管理，可以拿到厂商政策支持和返利，合理控制自营及控销品种，毛利会上浮3到5个百分点，但其净利润受运营成本影响，可能会更低。通常药品占销售份额的50%～70%左右，且分为处方药物和OTC类，处方药、医院品种、广告品种毛利通常较低。保健品均毛利不会低于40%，促销方面比药品更加灵活多样，在超A类、A类药店会占到30%左右的销售份额，普通药店也有15%左右的占比。医疗器械毛利在近些年是高过药品的，但销售渠道较多，药店并非其主要阵地，在销售项目中的占比通常不超过15%。母婴用品为了争夺市场可以说是费尽心机，利用其堪比保健品的利润开拓出药店渠道，同时又在超市卖场、专营门店上做文章，堪称集线下渠道之大成者，不知道什么时候才能将精力集中到产品本身。一般母婴用品在药店会有5%～15%的销售份额。中医馆是近些年药店看中的利润增长点，是结合了诊疗服务的销售，很多中医馆会兜售自己的中医处方，对消费者而言，其利润更加模糊化，卖点就是一千元的方子一百元的药。其带来了客户粘合度、重复购买率等诸多利好是传统药品市场手段所无法比拟的。其大致毛利应在60%～300%之间，根据药店自身定位的不同，在销售占比中波动较大。康复理疗是药店另一个副业，作为一种服务项目，本身就处在较为复杂的市场环境中，各路江湖好汉你方唱罢我登场，烟熏火烤，奇葩手段层出不穷，本质上是独立于药店经营范围之外的存在。相对于越来越激烈的竞争，不断失守的毛利线，根据自身条件做出相应合理的调整，才是药店长期生存下去的正道。